一、诊断作用
人体有病时就会在腧穴上有所反应而做为针灸临床诊断的依据。如胃肠疾患的人常在足三里、地机等穴出现过敏压痛，有时并可在五至八胸椎附近触到软性异物；患有肺脏疾患的人，常在肺俞、中府等穴有压痛、过敏及皮下结节。
因此，临床上常用指压背俞穴、募穴、郄穴、原穴的方法，察其腧穴的压痛、过敏、肿胀、硬结、凉、热，以及局部肌肉的隆起，凹陷坚实虚软程度，皮肤的色泽、瘀点、丘疹、脱屑等来协助诊断。
近来，在利用腧穴协助诊断方面又有新的发展，如耳廓中耳穴的测定，对原穴用导电量的测定，对十二井穴用知热感度的测定等等。通过仪器对这些腧穴的测定，可以在一定程度上反应经络、脏腑、组织器官的病变，为协助诊断增添了新的内容。
二、治疗作用
①近治作用
这是一切腧穴主治作用所具有的共同特点。这些腧穴均能治疗该穴所在部位及邻近组织、器官的病症。如眼区的睛明、承泣、四白、瞳子髎，均能治疗眼病；耳区的听宫、听会、耳门、翳风诸穴，皆能治疗耳病；胃部的中脘、建里、梁门诸穴，皆能治疗胃病等。
②远治作用
这是十四经腧穴主治作用的基本规律。在十四经腧穴中，尤其是十二经脉在四肢肘、膝关节以下的腧穴，则不仅能治疗局部病症，而且还可以治疗本经循行所及的远隔部位的脏腑、组织、器官的病症，有的甚至具有影响全身的作用。例如：合谷穴不仅能治疗手腕部病症，而且还能治疗颈部和头面部病症，同时，还能治疗外感病的发热；足三里穴不仅能治疗下肢病症，而且对调整整个消化系统的功能，甚至对人体防卫、免疫反应方面都具有很大的作用。
③特殊作用
临床实践证明，针刺某些腧穴，对机体的不同状态可引起双向的良性调整作用。例如：泄泻时，针刺天枢能止泻；便秘时，针刺天枢又能通便。此外，腧穴的治疗作用还具有相对的特异性，如大椎退热，至阴矫正胎位等，均是其特殊的治疗作用。
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